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創新藥研發九死一生，CADD/AIDD是答案嗎？
創新藥內卷嚴重，九死一生，而且燒錢速度驚人。不管Big Pharma還是Biotech都壓力山大，銷售額、利潤要漲，研發費用要邊漲邊控。Biotech求活下去，求快速具備造血能力；Big Pharma求踩穩創新藥這一條新成長曲線，探索國際化的發展模式。如何做到：速度要快，姿勢還要帥？第一：堆新藥研發人才自己培養和直接搶人，這兩條路一般同時進行。培養一個新藥研發人才和培養一個飛行員差不多，得用昂貴的
2023-05-12 hanhong
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ACS Med. Chem. Lett.｜虛擬篩選發現CDK5介導的PPARγ磷酸化抑制劑
抑制 PPARγ Ser273 磷酸化但缺乏經典 PPARγ 激動作用的化合物已成為更安全的抗糖尿病療法。通過虛擬篩選發現了化合物10，實驗證實它是一種有效的 PPARγ 結合劑和 CDK5 介導的 PPARγ Ser273 磷酸化的體外抑制劑。背景噻唑烷二酮類（TZDs）PPARγ 激動劑如羅格列酮和吡格列酮是有效的降糖藥，但受副作用影響限制了它們的使用。其正向抗糖尿病作用主要是通過抑制CDK5
2023-05-12 hanhong
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通過基于結構的虛擬篩選進行藥物重新定位
大片專利到期以及越來越嚴格的批準規定，迫使制藥行業尋求和開發有效的藥物發現技術。在過去的幾十年中，計算算法和計算機處理能力的進步使基于結構的虛擬篩選成為早期藥物發現和開發中的流行工具。使用計算技術能夠識別潛在候選藥物大大減少化學合成和體外測試所需的時間和成本。同時，尋找現有藥物的新用途已經成為補充研發管線的戰略。開發現有藥物新適應癥的方法稱為藥物重新定位。 藥物重新定位：原理、動機和實踐考慮
2023-05-12 hanhong
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新型藥物篩選研發平臺——SBDD
隨著技術要求的不斷提升，在傳統新藥篩選技術的基礎上，一些新的藥物篩選平臺應運而生。本站將介紹五種新型藥物篩選研發平臺，本篇介紹第四種——SBDD。什么是SBDD（基于結構的藥物發現平臺） Structure-based drug design，即基于結構的藥物設計，從配體和靶點的三維結構出發，以分子識別為基礎而進行的一種藥物設計方法。根據藥物與其作用的靶點如受體、酶、離子通道、核酸、抗原、病毒
2023-05-12 hanhong
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Science丨依據結構篩選藥物的范例——通過GPCR結構信息篩選D4多巴胺受體激動劑
日前，Science雜志發表了來自美國北卡羅萊納大學教堂山分校汪勝博士領銜完成的題為“D4 dopamine receptor high-resolution structures enable the discovery of selective agonists”的研究論文，該研究利用脂立方 (Lipidic cubic phase, LCP) 技術解析出D4多巴胺受體的超高分辨率晶體結構（1
2023-05-12 hanhong
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基于結構的藥物分子虛擬篩選以及藥物與靶點作用機制的研究
先天免疫系統是機體保護病原菌感染的進化保守機制。我們課題組主要圍繞天然免疫領域展開工作，系統的研究和發現了鴉片和其他精神活性物質的非經典受體，對藥物成癮和疼痛研究意義十分重大，得到國際同行的高度評價；正在開展的23s核糖體RNA的先天免疫識別和基于LMP-1第五跨膜結構域為靶點治療EB病毒誘導鼻咽癌的藥物研發等都具有非常重要的科學意義。Toll-like receptors（TLRs）是進化上非常
2023-05-12 hanhong
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VirtualFlow 實現超高通量虛擬篩選
摘要VirtualFlow 是一款開源的、基于結構的、超高通量虛擬篩選平臺，Gorulla 等人成功地用8000個核心花兩周時間完成對10多億化合物進行虛擬篩選，發現了 nM 水平的 KEAP1 抑制劑。本文演示了如何在 Cloudam 上使用 VirtualFlow 進行此類超高通量虛擬篩選，以 VirtualFlow 自帶的算例 VFVS_GK 演示了：1）如何準備輸入文件；2）編輯配置文件；
2023-05-12 hanhong
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基于片段的藥物設計研究進展
專家介紹：陸小云博士，研究員，博士生導師，國家優秀青年基金獲得者，863 青年科學家，廣東省杰出青年基金獲得者等。近年來重點圍繞肺結核和肺癌等重要肺部疾病的臨床需求，針對疾病密切相關的生物學靶標，利用“基于結構的藥物設計”為技術手段，設計和合成全新的藥物先導物，為治療肺部疾病的創新藥物研發提供化學物質基礎。以第一或通訊作者在 Angew Chem Int Edit 和 J Med Chem 等本專
2023-05-12 hanhong
